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圣胡安老城的许多街道都铺有使用炼铁废料制成的蓝色鹅卵石。
这些著名的鹅卵石在 18 世纪作为欧洲轮船上的压舱物带到圣胡安，随后被用于铺设圣胡安的街道。随着年复一年的磨损和日晒雨淋，这些鹅卵石形成了自己标志性的蓝色。
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波多黎各是世界上最大的活海龟 － 棱皮龟 － 的故乡。
世界野生动物基金会将棱皮龟在波多黎各分类为易危物种，但其在其他地区已是极危物种。Proyecto Tinglado 保育项目以波多黎各的库莱布拉岛 (Culebra) 为基地，该岛是世界上为数不多的棱背龟数量呈上升趋势的地区之一。
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波多黎各的非官方吉祥物是科基树蛙 (coquí tree frog)，这种小小的生物拥有独特的高音调鸣叫，从黄昏到破晓，您都能在整座岛屿上听到。
科基树蛙身长只有 1 到 2 英寸（2.5 到 5 厘米），体重为 2 到 4 盎司（57 到 113 克）。雄性科基树蛙发出"咯"声鸣叫阻退其他雄性，发出"科基"声鸣叫吸引雌性，但最近的气候变化导致其鸣唱发生变化，这可能会影响其生存。
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云盖国家森林公园 (El Yunque) 距圣胡安仅数小时车程，是美国国家森林体系内唯一的热带雨林。
云盖国家森林公园是该体系内占地面积较小的森林，但云盖拥有的数百种植物和动物种类让它成为最具生物多样性的森林之一。遭受飓风伊尔玛和飓风玛利亚侵袭后，损害评估和清理工作一直在持续进行，最新进展定期在美国国家森林局的网站上发布。
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1992 年，波多黎各的阿雷西博天文台 (Arecibo Observatory) 发现了第一颗位于太阳系外的行星。
阿雷西博望远镜是世界第二大单面口径射电望远镜。其镶嵌在天然石灰岩坑 洞中，盘面直径达 1,000 英尺（305 米），深度达 167 英尺（51 米），占地面积约为 20 英亩。阿雷西博天文台于 1963 年开始运行，参与了许多其他重大发现。1967 年，阿雷西博天文台测得水星的自转周期仅为 59 天，而不是我们之前认为的 88 天。
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卡穆伊河洞穴公园 (Camuy River Cave Park) 是波多黎各的自然奇观之一， 它拥有超过 200 个可供探索的洞穴。
卡穆伊河雕刻出世界最大的地下洞穴网，四周环绕占地 268 英亩的公园。Clara 洞穴 (Cueva Clara) 大气十足，高度在 170 英尺（52 米）以上，宽度在 200 英尺（61 米）以上。除了令人印象深刻的构造外，还有激流和滴水以及蝙蝠带来的诡异回声。
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波多黎各不是单个岛屿；它实际上是由一个主岛和若干小岛组成的群岛。
波多黎各群岛是大安地列斯群岛的一部分。波多黎各岛是其中最大的岛，但还有三个主要的沿海岛屿：别克斯岛 (Vieques)、库莱布拉岛 (Culebra) 和莫纳岛 (Mona)。在这三个岛屿中，仅别克斯岛和库莱布拉岛有人居住，莫纳岛没有已知的水源。
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圣胡安堡垒 (La Fortaleza) 和圣胡安国家历史遗址 (San Juan National Historic Site) 被列为联合国科教文组织世界遗产。
该遗址建造于 16 世纪到 20 世纪，由防御工事和圣胡安城的部分老城墙组成。圣胡安堡垒建造于 1533 到 1540 年间，是其最古老的建筑，前身是军械库和监狱。该堡垒现在是波多黎各总督的办公处和居所。
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波多黎各海沟是大西洋的最深处，也是世界上最深的海沟之一。
波多黎各海沟位于波多黎各以北，将大西洋和加勒比海分隔开来。海沟最深处有 5.2 英里（8.4 千米）深。该处地形复杂，并与地球上最大的重力负异常带（或向下力）关联。
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皮纳科拉达是在波多黎各发明的，但细节有争议。
Caribe Hilton 酒店声称其调酒师 Ramon Marrero 于 1954 年调出了第一杯皮纳科拉达。但该酒店的另一名调酒师 Ricardo Gracia 表示是自己发明的，只不过他当时正在罢工，因而没有用来招待客人。Restaurant Barrachina 餐厅门前的一块牌匾则声称是该餐厅于 1963 年发明了这一饮品。无论事实真相如何，皮纳科拉达在 1978 年成为波多黎各的国饮。